MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF plasmid pNTHE02

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010724	TGAA	2	8	14	21	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010724	GTG	2	6	38	43	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010724	TAA	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010724	T	7	7	73	79	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010724	AT	3	6	81	86	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010724	A	7	7	102	108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010724	GGA	3	9	109	117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010724	AGG	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010724	TCC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_010724	AC	4	8	2429	2436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010724	TG	3	6	2442	2447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010724	TAA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010724	ATA	2	6	2477	2482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010724	CAA	2	6	3041	3046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010724	TAAC	2	8	3102	3109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010724	A	6	6	3174	3179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010724	AGG	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010724	TAAA	2	8	3999	4006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010724	A	7	7	4004	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010724	AT	3	6	4110	4115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010724	CTC	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_010724	GAG	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010724	TCC	2	6	5505	5510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_010724	TGA	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010724	A	6	6	5559	5564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010724	ATAAA	2	10	5570	5579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010724	TAAA	2	8	5611	5618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010724	GTGA	2	8	5654	5661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010724	AAG	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010724	CCTTTT	2	12	5690	5701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010724	CTT	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010724	AGG	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010724	T	6	6	5825	5830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010724	A	6	6	7835	7840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010724	TAT	2	6	7884	7889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010724	CCG	2	6	7928	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_010724	TTTA	2	8	7975	7982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010724	TTTTA	2	10	8012	8021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010724	GAGAA	2	10	8031	8040	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010724	CTTATT	2	12	8049	8060	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010724	A	9	9	8128	8136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010724	TA	3	6	8137	8142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010724	AATAAG	2	12	8148	8159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010724	GGT	2	6	8426	8431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010724	TC	3	6	8434	8439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010724	GAT	2	6	8519	8524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010724	CCG	2	6	8554	8559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010724	GAAGA	2	10	8593	8602	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010724	TAAA	3	12	8612	8623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010724	GAT	2	6	8633	8638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.